Colistin resistance in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in humans and backyard animals in Ecuador / Resistencia a la colistina de las bacterias Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae en humanos y animales de granja en Ecuador / Resistência à colistina em Escherichia coli e Klebsiella pneumoniae em humanos e animais de quintal no Equador

ABSTRACT Objective. Colistin is an antibiotic of last resort for treating serious Gram-negative bacterial infections. However, the misuse of colistin, especially as an animal growth promoter, has contributed to increasing antimicrobial resistance, mediated mainly through plasmid transfer of the mcr-1 gene. This study assessed the prevalence of phenotypic and molecular colistin resistance in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Ecuador in healthy humans and their chickens and pigs. Methods. Fecal samples were collected from humans and their chickens and pigs in two rural coastal and Amazon regions between April and August 2020. Gram-negative bacteria were isolated and identified using conventional techniques. Phenotypic resistance was determined using the broth microdilution technique, and the mcr-1 gene was detected using conventional polymerase chain reaction. Results. A total of 438 fecal samples were obtained from 137 humans, 147 pigs and 154 chickens. The prevalence of E. coli isolates was 86.3% (378/438) and K. pneumoniae, 37.4% (164/438). Overall, the mcr-1 gene was found in 90% (340/378) of E. coli isolates, with higher prevalences found in isolates from coastal regions (96.5%, 191/198), humans (95.6%, 111/116) and chickens (91.8%, 123/134); for K. pneumoniae, the gene was found in 19.5% (32/164) of isolates, with equal distribution between regions and hosts. Only four isolates, two E. coli and two K. pneumoniae, showed phenotypic resistance: mcr-1 was present in both E. coli strains but absent in the K. pneumoniae strains. Conclusions. Despite a low prevalence of phenotypic resistance to colistin, the high prevalence of the mcr-1 gene in E. coli is of concern. Ecuador's ban on using colistin in animal husbandry must be enforced, and continual monitoring of the situation should be implemented.

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RESUMO Objetivo. A colistina é um antibiótico de último recurso para o tratamento de infecções graves por bactérias Gram-negativas. Entretanto, o uso indevido da colistina, principalmente como promotor de crescimento animal, tem contribuído para o aumento da resistência a antimicrobianos, principalmente por transferência horizontal do gene mcr-1 mediada por plasmídeos. Este estudo avaliou a prevalência de resistência fenotípica e molecular à colistina em Escherichia coli e Klebsiella pneumoniae no Equador em humanos hígidos e em galinhas e porcos por eles criados. Métodos. Entre abril e agosto de 2020, foram coletadas amostras de fezes de habitantes de duas regiões litorâneas e amazônicas do Equador e de galinhas e porcos por eles criados. Bactérias Gram-negativas foram isoladas e identificadas por meio de técnicas convencionais. A resistência fenotípica foi determinada pela técnica de microdiluição em caldo, e o gene mcr-1 foi detectado por reação em cadeia da polimerase convencional. Resultados. Foram obtidas 438 amostras fecais de 137 humanos, 147 suínos e 154 galinhas. A prevalência de isolados de E. coli foi de 86,3% (378/438), e de K. pneumoniae, 37,4% (164/438). Em geral, o gene mcr-1 foi encontrado em 90% (340/378) dos isolados de E. coli, com maiores prevalências encontradas em isolados de regiões litorâneas (96,5%, 191/198), humanos (95,6%, 111/116) e galinhas (91,8%, 123/134); para K. pneumoniae, o gene foi encontrado em 19,5% (32/164) dos isolados, com igual distribuição entre regiões e hospedeiros. Somente quatro isolados, dois de E. coli e dois de K. pneumoniae, demonstraram resistência fenotípica: o gene mcr-1 estava presente em ambas as cepas de E. coli, mas ausente nas de K. pneumoniae. Conclusões. Apesar da baixa prevalência de resistência fenotípica à colistina, a alta prevalência do gene mcr-1 em E. coli é preocupante. É preciso fiscalizar a proibição ao uso agropecuário de colistina no Equador e implementar o monitoramento contínuo da situação.

Infección por virus HTLV-1/2 confirmada por serología y detección de provirus en pacientes ecuatorianos de paraparesis espástica tropical / HTLV-1/2 virus infection confirmed by serology and provirus DNA detection in tropical spastic paraparesis Ecuadorian patients

Introduccion: La infección con el virus linfotrópico de células T humano (HTLV) de tipo 1 y 2 es endémica en América del Sur. Existen muy pocos reportes clínicos de este retrovirus en pacientes de Ecuador y nunca confirmaron la presencia del virus con el aislamiento o la detección de su ADN. Esta infección se encuentra desatendida por las autoridades de salud pública, sin que existan estudios epidemiológicos de prevalencia a nivel del país. Objetivos: Este estudio tiene como objetivo la detección de infección por HTLV -1/2 en individuos sintomáticos de paraparesis espástica tropical (TSP) utilizando por primera vez en Ecuador diagnóstico serológico y la detección del provirus por biología molecular. Diseño del estudio. Se tomaron muestras de nueve pacientes con un diagnóstico de mielopatía y sospechoso de TSP, que fueron analizadas para la detección del virus HTLV-1/2 usando tres metodologías: ELISA comercial, ensayo de inmunofluorescencia indirecta (IF) y PCR anidada. Resultados: Cinco de los 9 (55.5%) pacientes fueron positivos tanto para la prueba de ELISA como para IF y PCR anidada. Conclusión: La alta prevalencia de infección por HTLV-1/2 entre individuos sintomáticos de mielopatía muestra la endemicidad de este retrovirus en Ecuador, la asociación de HTLV-1/2 con TSP y la necesidad de implementar estrategias de control y prevención para evitar la diseminación de esta enfermedad infecciosa desatendida.

Background: Infection with the Human T-cell lymphotropic virus (HTLV) type 1 and 2 is endemic in South America. There are only a few clinical reports of this retrovirus in patients in Ecuador, without employing virus-isolation methods or viral DNA detection. The infection is usually neglected in health care settings and by public health authorities and no country wide prevalence data are available. Objectives: This study aims to detect the HTLV-1/2 infection in symptomatic individuals for tropical spastic paraparesis (TSP) using for the first time in Ecuador both immunological and molecular biology methodologies. Study Design: Blood samples of 9 symptomatic individuals with myelopathy were analyzed for the detection of the HTLV-1/2 virus with three methods: ELISA, an indirect immunofluorescence (IF) assay and a nested-PCR. Results: Five out of 9 (55.5%) myelopathy patients were positive for ELISA, IF and nested- HTLV-1/2 PCR. Conclusion. The high prevalence of HTLV-1/2 infection among myelopathy patients shows the endemicity of this retrovirus in Ecuador, the association of HTLV-1/2 infection with TSP and the need of the implementation of control and prevention interventions to overcome the further dissemination of this neglected infectious disease.

Newly sequenced genomes of four Bacillus Calmette Guerin vaccines

Bacillus Calmette Guerin (BCG) vaccines comprise a family of related strains. Whole genome sequencing has allowed the better characterisation of the differences between many of the BCG vaccines. As sequencing technologies improve, updating of publicly available sequence data becomes common practice. We hereby announce the draft genome of four commonly used BCG vaccines in Brazil, Argentina and Venezuela.

Comparación y evaluación de métodos cuantitativos para determinar la susceptibilidad antimicrobiana de cepas del complejo Mycobacterium abscessus / Comparison and Evaluation of Quantitative Methods for Determining Antimicrobial Susceptibility of Complex Mycobacterium Abscessus Strains / Comparação e avaliação de métodos quantitativos para determinar a susceptibilidade antimicrobiana de cepas do complexo Mycobacterium abscessos

Resumen Introducción: el complejo Mycobacterium abscessus incluye especies patógenas emergentes multirresistentes, lo cual limita las opciones terapéuticas para tratar las infecciones causadas por dichos microorganismos. En este estudio se compararon las concentraciones inhibitorias mínimas (CIM) obtenidas mediante dos métodos cuantitativos, se establecieron los puntos de corte empleados en el micrométodo colorimétrico (MMC) y se evaluó la susceptibilidad antimicrobiana. Materiales y métodos: la CIM de nueve antibióticos fue determinada mediante el MMC y la microdilución en caldo (MDC) para 19 cepas del complejo M. abscessus. El test F de Snedecor se utilizó para establecer la diferencia significativa de las CIM entre los dos métodos y se determinaron los puntos de corte mediante la técnica de distribución de la probabilidad para el MMC. Resultados: se encontró una correlación de los resultados de la CIM del 50% entre MMC y MDC para los antibióticos ensayados. Probablemente esta discrepancia en los resultados se deba a diferencias en algunos parámetros técnicos de cada procedimiento. Todas las cepas fueron sensibles a la amikacina y resistentes a meropenem y ampicilina-sulbactam. Independientemente de la especie del complejo M. abscessus, las fluoroquinolonas mostraron una baja actividad inhibitoria (0-25%) sobre los aislados clínicos, resultados que son similares a los reportados por otros autores. Conclusión: Los patrones de multirresistencia observados en las cepas analizadas sugieren la necesidad de utilizar las pruebas de susceptibilidad como herramientas que permitan orientar y optimizar las conductas terapéuticas en infecciones producidas por M. abscessus.

Abstract Introduction: The Mycobacterium abscessus complex includes multidrug resistant emerging pathogens, which limit therapeutic options for treating infections caused by these microorganisms. In this study, the minimum inhibitory concentrations (MICS) obtained by 2 quantitative methods were compared, the cut-off points used in the colorimetric micromethod (CMM) were established and the antimicrobial susceptibility was evaluated. Materials and Methods: The MIC for nine antibiotics was determined by CMM and broth microdilution (BMD) for 19 strains of M. abscessus complex. The Snedecor F test was used to establish the significant difference in the CIM between the methods, cutoff points were determined by the probability distribution method for the CMM. Discussion: A correlation of 50% between CMM and BMD for antibiotics tested was found. Probably, this discrepancy in the results is due to differences in some technical parameters of each procedure. All strains were susceptible to amikacin and were resistant to meropenem and ampicillin-sulbactam. Independently of the species of M. abscessus complex, fluoroquinolones showed a low inhibitory activity (0-25%) on clinical isolates, results that are similar to those reported by other authors. Conclussion: The Multidrug resistance patterns observed in the strains tested suggest the need for susceptibility testing as tools to guide and optimize the therapeutic behavior in infections caused by M. abscessus.

Resumo Introdução: o complexo Mycobacterium abscessus inclui espécies patógenas emergentes multirresistentes, o qual limita as opções terapêuticas para tratar as infeções causadas por estes microrganismos. Neste estudo compararam-se as concentrações inibitórias mínimas (CIMS) obtidas mediante 2 métodos quantitativos, se estabeleceram os pontos de corte empregados no micrométodo colorimétrico (MMC) e se avaliou a susceptibilidade antimicrobiana. Materiais e métodos: a CIM de 9 antibióticos foi determinada mediante o MMC e microdiluição em caldo (MDC) para 19 cepas do complexo M. abscessus. O teste F de Snedecor utilizou-se para estabelecer a diferença significativa das CIMS entre os dois métodos e determinaram-se os pontos de corte mediante a técnica de distribuição da probabilidade para o MMC. Resultados: se encontrou uma correlação dos resultados da CIM do 50% entre MMC e MDC para os antibióticos testados. Provavelmente, esta discrepância nos resultados se deve a diferenças em alguns parâmetros técnicos de cada procedimento. Todas as cepas foram sensíveis à amikacina e resistentes a meropenem e ampicilina-sulbactam. Independentemente da espécie do complexo M. abscessos, as fluoroquinolonas mostraram uma baixa atividade inibitória (0-25%) sobre os isolados clínicos, resultados que são similares aos reportados por outros autores. Conclussão: Os patrões de multirresistência observados nas cepas analisadas, sugerem a necessidade de utilizar as provas de susceptibilidade como ferramentas que permitam orientar e otimizar as condutas terapêuticas em infeções produzidas por M. abscessus.

Mecanismos de resistencia en micobacterias de crecimiento rápido / Resistance mechanisms of rapid growing mycobacteria

Las Micobacterias de crecimiento rápido (MCR) son patógenos oportunistas capaces de ocasionar infecciones en piel, pulmonares y diseminadas. En Venezuela existe un incremento de estas infecciones derivadas de procedimientos invasivos, entre ellas cirugías estéticas. El tratamiento de esas infecciones requiere la administración de al menos dos antibióticos por varios meses. En la presente revisión se describe los mecanismos de resistencia a los antibióticos que se han reportado en las MCR, principalmente las tres especies que frecuentemente se han asociado a infecciones en piel: M. abscessus, M. chelonae y M. fortuitum. Los factores más importantes relacionados a la resistencia en los esquemas de tratamiento son: cambios relacionados en la permeabilidad de la membrana al antibiótico, la inactivación enzimática y modificaciones del sitio blanco. En MCR se han evidenciado la presencia de betalactamasas con actividad penicilinasas y cefalosporinasas y de acetil-transferasas que pueden modificar los aminoglicósidos. Las modificaciones de las regiones ARNr 23S y ARNr 16S han permitido explicar, en parte, la resistencia a macrólidos y aminoglicósidos. La metilación de los sitios blanco de acción de los macrólidos es otro factor importante, sobre todo en especies como M. abscessus. Éste último mecanismo explica la falla terapéutica que se ha reportado en pacientes tanto en infecciones pulmonares como en infecciones en piel. Es necesario ampliar el estudio sobre los mecanismos de resistencia en estas especies, tomando en consideración las complicaciones que llevan estas infecciones y los tiempos prolongados de tratamientos pudiendo generar efectos secundarios en los pacientes y la frustración cuando ocurre la falla terapéutica.

The rapid growing mycobacteria (RGM) are opportunist pathogens able to cause skin, pulmonary and disseminated infections. In Venezuela there is an increase in the prevalence of these infections especially following esthetic surgery. The treatment of such infections is cumbersome requiring the administration of at least two antibiotics for several months. In the present review we describe the principal antibiotic resistance mechanisms reported for RGM, particular for the species most frequently associated with skin and soft tissue infection: M. abscessus, M. chelonae and M. fortuitum. The most important factors associated with resistance to antibiotics are impermeability of the cell membrane, enzymatic inactivation and changes in the target site. In RGM the presence of the beta-lactamases with penicillinases and cephalosporinase activity has been demonstrated and the presence of acetyl-transferases which can modify aminoglycosides. Changes in the 23S rRNA and 16S rRNA regions has allowed to explain, partly macrolide and aminoglycoside resistance. Mutation in the macrolide target site is another important resistance mechanism, particularly for the species group M. abscessus. This last mechanism can explain treatment failure reported in the patients with pulmonary or skin infection. We conclude that there is a need for more extensive studies about the mechanisms of antibiotic resistance of RGM; taking into account the complications of these infections, the prolonged treatment long time, producing secondary effects and the frustrations of patient and physician caused by therapeutic failures.

Rhodococcus equi en paciente VIH/sida: primera detección molecular en Cuba / First molecular detection of Rhodococcus equi in a HIV/aids patient in Cuba

Introducción: Rhodococcus equi es reconocido como un patógeno emergente que causa importante morbilidad y mortalidad entre los pacientes inmunocomprometidos. Objetivo: confirmar la presencia de R. equi en líquido pleural mediante la técnica del polimorfismo en la longitud de los fragmentos de restricción. Métodos: se empleó muestra de líquido pleural de un paciente sida con síntomas respiratorios. Se realizaron cultivos microbiológicos, pruebas de tinción, fenotípicas, bioquímicas y la técnica del polimorfismo en la longitud de los fragmentos de restricción para el diagnóstico del microorganismo. Resultados: las técnicas de tinción, fenotípicas y bioquímicas brindaron un diagnóstico sugestivo de infección por R. equi, el cual fue confirmado por las técnicas moleculares utilizadas. Conclusiones: este trabajo reporta la detección molecular, por primera vez en Cuba, de R. equi en paciente VIH/sida. Los resultados obtenidos permiten sugerir que técnicas de biología molecular pueden ser aplicadas en el diagnóstico y la identificación de R. equi.

Introduction: Rhodococcus equi is recognized as an emerging pathogen that causes important morbidity and mortality among immunocompromised patients. Objective: to confirm the presence of R. equi in pleural fluid through the restriction fragment length polymorphism technique. Methods: the pleural fluid sample from one AIDS patient with respiratory symptoms was used. Microbiologic culture, staining tests, phenotypic and biochemical tests and restriction fragment length polymorphism technique for the diagnosis of microorganism were performed. Results: the staining technique along with the phenotypic and biochemical tests provided the presumptive diagnosis of R. equi infection, which was further confirmed by the molecular techniques. Conclusions: this paper reported the molecular detection of R. equi from one HIV/aids patient for the first time in Cuba. The results suggested that the molecular biology techniques could be used in the diagnosis and identification of R. equi.

Diagnostic accuracy of immunological methods in patients with tuberculous pleural effusion from Venezuela / Precisión diagnóstica de métodos inmunológicos en pacientes con tuberculosis pleural de Venezuela

In recent years, better diagnostics for tuberculosis (TB) has received increasing attention, especially the diagnosis of tuberculous pleural effusion, which is difficult and at present the main tool in TPE diagnostic is pleural effusion smear and culture, but unfortunately, sensitivities are low, therefore better TPE diagnostic tools are needed. The aim of this study was to find a diagnostic algorithm to assess the progress in TPE diagnostic at the Hospital Vargas de Caracas, that permits identification of the majority of patients, at a satisfactory cost-benefit ratio, evaluating the levels of IFN-g and IL-12p40 in pleural effusion and serum, as well as the antibody reactivity in order to compare it with microbiological tests. A total of 60 individuals with pleural effusion were studied; 20 patients with tuberculous pleural effusion (TPE) formed the patient group and 40 patients with non-tuberculous pleural effusion (NTPE) formed the control group. The levels of IFN-g and IL-12p40 in effusion and serum and class and subclasses of IgG reactivity to Mycobacterium tuberculosis antigens were measured by ELISA. The utility of these methods for diagnosis of TPE was evaluated using receiver operating characteristic (ROC) curve analysis. The results of the 11 immunological methods evaluated showed that the anti-PPD IgG2 method was able to reach the highest specificity of 95% (CI: 88.3-101.8), positive predictive value (PPV)=75 (at 30% sensitivity); while that the overall sensitivity of methods was between 95% and 30%, of these, two methods reached higher sensitivities; increased levels of pleural IFN-g, with a sensitivity of 95% (CI: 85.5-104.5) with the highest negative predictive value (NPV)=97, (at 82.5% specificity), followed by decreased levels of serum IL-12p40 with a sensitivity of 95% (CI: 85.5-104.5), NPV=95.2 (at 50% specificity). In contrast, microbiological methods showed that smear had a sensitivity of only 20%, while smear plus ...

Recientemente existe un gran interés hacia un mejor y más rápido diagnóstico de tuberculosis (TB), especialmente de tuberculosis pleural, el cual es difícil. Al presente las principales herramientas diagnósticas son la baciloscopia y el cultivo de líquido pleural; desafortunadamente, las sensibilidades de estos métodos son bajas, por lo que el desarrollo de nuevas herramientas diagnósticas es necesario. El objetivo del presente estudio consistió en encontrar un algoritmo que permita la rápida identificación de la mayoría de los pacientes con TB pleural que ingresan en el Hospital Vargas de Caracas a un buen costo-beneficio. Para esto se evaluaron los niveles de las citocinas Interferón-gamma (IFN-g) y la Interleucina 12p40 (IL-12p40) en líquido pleural y suero, así como la reactividad de anticuerpos contra antígenos de Mycobacterium tuberculosis. Se estudiaron 60 individuos con derrame pleural; 20 individuos con líquido pleural tuberculoso (LPT) conformaron el grupo de pacientes y 40 individuos con líquido pleural no tuberculoso (LPNT) el grupo de controles. La técnica de inmunoensayo de ELISA fue utilizada para medir los niveles de IFN-g y IL-12p40; así como las reactividades de los diversos isotipos y subclases de inmunoglobulina G (IgG) frente a antígenos del bacilo. La utilidad de los métodos fue evaluada utilizando el análisis de las curvas ROC (receiver operating characteristic). Los resultados de los 11 métodos inmunológicos evaluados mostraron que el método IgG2 anti-PPD alcanzó la mayor especificidad de 95%, (CI: 88,3-101,8) con un valor predictivo positivo (VPP) de 75. La sensibilidad de los métodos estuvo entre 30% y 95%; dos métodos alcanzaron altas sensibilidades: los altos niveles de IFN-g en líquido pleural, con sensibilidad de 95% (CI: 85,5-104,5), con un valor predictivo negativo (VPN) de 97, seguido de los bajos niveles de IL-12p40 en suero, con una sensibilidad de 95% (CI: 85,5-104,5) con un VPN de 95,2. En contraste, ...

Resistencia a drogas antituberculosas en Caracas, Venezuela; 2001-2006 / Antituberculosis drug resistance in Caracas, Venezuela; 2001-2006

Para establecer la sensibilidad de las cepas de Mycobac-terium tuberculosis aisladas en Caracas, entre 2001 y 2006, fueron probadas utilizando el método colorimétrico para determinar las Concentraciones Inhibitorias Mínimas (CIM). De las 324 cepas, 46 (14,2%) mostraron resistencia a una o más drogas. Encontramos resistencia de alto nivel (CIM 8 µg/ml) y bajo nivel (CIM 1-4 µg/ml) a Estreptomicina en 6 (1,8%) y 25 (7,7%) de las cepas, respectivamente. Se encontró resistencia a Isoniacida de bajo nivel (MIC 0,125 - 0,5 µg/ml) en 8 (2,5%) y de alto nivel (MIC 1,0 µg/ml) en 15 (4,6%) de las cepas estudiadas. Hallamos 13 (4,0%) cepas resistentes a Rifampicina (RIF) (5 µg/ml) y 11 (3,4%) a Etambutol (10 µg/ml). De los 17 (5,2%) aislamientos resistentes a dos o más drogas, 12 (3,7%) fueron resistentes a INH y RIF (definido como multirresistencia, MDR). De las 12 cepas MDR, 11 fueron aisladas a partir de esputo y una de líquido pleural. Este estudio muestra un incremento en la prevalencia de la resistencia a las drogas antituberculosas en Caracas, especialmente las cepas MDR. Este aumento apunta hacia la necesidad de una encuesta na-cional, para evaluar el panorama real de la resistencia.

To asses drug susceptibility of Mycobacterium tuberculosis strains isolated from 2001 to 2006 in Caracas. Available strains were tested using colorimetric method to determine the Minimal Inhibitory Concentrations (MIC). Of 324 strains, 46 (14,2%) showed resistance to one or more drugs. High-resistance (8 µg/ml) and low-resistance (1-4 µg/ml) to Strep omycint was found in 6 (1,8%) and 25 (7,7%) strains, respectively. Isoniazid (INH) low-resistance (MIC 0.125 - 0.5 µg/ml) were found in 8 (2,5%) and high-resistant (MIC at 1.0 µg/ml) in 15 (4,6%), Rifampicin resistance (RMP) (5 µg/ml) in 13 (4%), and Ethambutol resistance (10 µg/ml) in 11 (3,4%) of the strains. Of the 17 (5,2%) isolates resistant to two or more drugs, 12 (3,7%) were resistant to INH and RMP (defined as multidrug resistance, MDR). Of these 12 MDR strains, 11 were isolated from sputum and one from pleu ral fluid. This study shows an increased prevalence of resistance to anti-tuberculosis drugs in Caracas, especially the prevalence of MDR strains, raises an urgent need of a proper nationwide survey to evaluate the true picture of resistance.

Susceptibilidad de M. tuberculosis a drogas antituberculosas, determinada por dos técnicas, en el estado Sucre, Venezuela / usceptibility of M. tuberculosis to antituberculosis drugs as determined by two methods, in Sucre state, Venezuela

El objetivo de este trabajo fue evaluar la resistencia a isoniacida (INH), rifampicina (RIF), estreptomicina (STR) y etambutol (EMB) de 59 cepas de Mycobacterium tuberculosis, aisladas en el período agosto 2005-diciembre 2006, en el estado Sucre, Venezuela, empleando el método de proporciones de Canetti y de nitrato reductasa. Se encontró 6,3% de resistencia primaria y 14,3% de adquirida. Una cepa fue considerada MDR, al presentar resistencia a RIF e INH. Se comparó la prueba de nitrato reductasa con el método de las proporciones, encontrándose 100% de concordancia entre los resultados de los dos métodos para INH, RIF y EMB, y 95,65% para STR. Además, la prueba nitrato reductasa produjo resultados en 10 a 14 días, comparado con 42 días para el método de proporciones, por lo que la primera se postula como una alternativa muy valiosa para acortar el tiempo de respuesta en la valoración de la susceptibilidad de M. tuberculosis. La secuencia del gen rpoB en la cepa resistente a RIF demostró la presencia de una mutación no descrita anteriormente en la región hipervariable de 81 pares de bases, donde se ha reportado el mayor número de mutaciones de cepas resistentes a RIF. Esta mutación produjo un cambio en el codón 456 de TCG > CAG. Al comparar nuestros resultados con los hallados en el último estudio de prevalencia de resistencia realizado en el estado, se demuestra una disminución en la circulación de cepas resistentes en la zona de estudio.

The objective of this study was to evaluate the resistance to isoniazid (INH), rifampicin (RIF), streptomycin (STR) and ethambutol (EMB), with the Canetti’s proportions method (PM) and the nitrate reductase assay (NRA) of 59 clinical strains of Mycobacterium tuberculosis, isolated in the period of august 2005 to december 2006, in Sucre state, Venezuela. Primary and acquired drug resistance was 6.3% and 14.3%, respectively. Only one strain was found to be multidrug resistant (MDR). The overall agreement between the NRA and PM was 100% for INH, RIF and EMB, and 96% for STR. The time to obtain results was 10 to 14 days for the NRA, compared to 42 days for the PM. The NRA was easy to perform and therefore represents a useful tool for rapid and accurate determination of drug-resistant M. tuberculosis. The sequence of the rpoB gene of the RIF resistant strain demonstrated a never described mutation (change in the codon 456; TCG > CAG) in the hypervariable region of 81 base pairs where most of the mutations of the RIF resistant strains have been reported. Comparison of our results with those of the last resistance prevalence study carried out in the years 1998-1999, shows a decrease in the studied area.

Ordeñando micobacterias del ganado?: impacto económico y en salud de tuberculosis bovina y paratuberculosis en Colombia / Milking mycobacteria from cattle?: health and economic impact of bovine tuberculosis and paratuberculosis in Colombia

La tuberculosis bovina y la paratuberculosis o enfermedad de Johne’s son enfermedades infecciosas en rumiantes, causadas por M. bovis y M. paratuberculosis respectivamente. La tuberculosis bovina es una enfermedad crónica de los rumiantes que guarda estrecha relación con la tuberculosis humana y provoca un deterioro progresivo del estado general de salud del animal, pérdida de peso, muy a menudo con tos y, a la larga, la muerte. La Paratuberculosis es una enfermedad infecto-contagiosa del tracto intestinal y se caracteriza por provocarenteritis granulomatosa crónica y progresiva, y diarreas sin respuesta a un tratamiento. Ambas enfermedades afectan especialmente los bovinos. Ambas bacterias son excretadas en la leche de los bovinos afectados, y por eso el consumo de leche cruda o queso fresco elaborado con leche cruda es la fuente de diseminación más importante de estas enfermedades tanto como entre los animales y al hombre. El impacto de estas enfermedades para la salud humana y la sanidad animal, la economía y el comercio es significativo y por esta razón están entre las enfermedades de declaración obligatoria a La Organización Mundial de Sanidad Animal (OIE) (1).

Serotipos invasivos de Streptococcus pneumoniae en niños menores de 5 anos en Venezuela: 1999-2007 / Serotype distribution of invasive isolates of Streptococcus pneumoniae from Venezuelan children under 5 years of age between: 1999-2007

Introduccion: La enfermedad neumococica es una de las principales causas de mortalidad infantil en el mundo. Ob je - tivo: Determinar los serotipos de Streptococcus pneumoniae que producen enfermedad invasiva en ninos menores de 5 anos en Venezuela. Materiales y Metodos: Se establecieron 7 hospitales centinelas. El estudio incluyo variables demograficas y epidemiologicas. El Instituto Nacional de Higiene Rafael Rangel realizo la confirmacion y serotipificacion de las cepas. Resultados: Entre 1999-2007 fueron se - ro tipificadas 493 cepas de S. pneumoniae. Los serotipos mas frecuentes fueron el 14 (34,9%), 6B (13,8%), 5 (9,1%), 1 (6,1%) y 19A (6,1%), que correspondieron al 70% de las cepas. La cobertura global de la vacuna polisacarida conjugada heptavalente seria de 66,9% en bacteriemias, 56,6% en neumonias y 64,6% en meningitis. La va cuna decavalente tendria una cobertura teorica global de 76,9%, con valores similares en las tres entidades clinicas y la trecevalente tendria una cobertura potencial teorica de 90%. Conclu sio - nes: Esta investigacion reporta la distribucion de los serotipos invasivos de S. pneumoniae en Venezuela y permiten in ferir que la introduccion de vacunas neumococicas conjugadas en nuestra poblacion pediatrica ten drian un impacto positivo en la prevencion de la enfermedad.

Background: Pneumococcal disease is the principal cause of morbidity and mortality in children. Objective: To determi - ne the serotype distribution of invasive S. pneumoniae strains isolated from children under 5 years in Venezuela. Ma terials and Methods: 7 hospitals settled down sentries. The study included demographic variables and epidemiologists. The National Institute of Higiene gRafael Rangelh rea li - sed the confirmation and serotyping of the strains. Results: Bet ween 1999-2007 493 strains of S. pneumoniae were se - ro typing. The most frequent serotypes, with 70% of all the strains belonging to these 5 serotypes were: 14 (34,9%), 6B (13,8%), 5 (9,1%), 1 (6,1%) and 19A (6,1%). The potential co verage of the 7-valent conjugate vaccine is 66,9% for bacteriemia, 56,6% for pneumonias and 64,6% for meningitis respectively. The potential coverage of the 10-valent conjugate vaccine is (76,9%) with similar values for the three clini cal manifestations and the 13-valent has a potential coverage of 90%. Conclusions: This investigation reports the distribution of invasive S. pneumoniae serotypes in Venezuela and allow to infer that the conjugated vaccines introduction in our pediatric population could have a positive impact on the prevention of pneumococcal disease.

Baciloscopia positiva persistente en fase avanzada de la terapia anti-tuberculosa: No siempre indica fracaso del tratamiento / Persistent positive baciloscopy after several months of tuberculosis therapy: Not always it represents a treatment failure

Agencias internacionales para el control de la tuberculosis (TBC) (WHO, IUATLD, KNCV) consideran fracasado el tratamiento anti-tuberculoso si finalizado el mismo, persiste la baciloscopia (BK) positiva. Describimos el caso de un paciente con TBC pulmonar que, tras completar correctamente el tratamiento por 6 meses, continuaba siendo bacilífero. Después de 9 meses con terapia específica, a pesar de una BK positiva persistente, su tratamiento fue suspendido, porque estaba asintomático, con el peso corporal recuperado y ninguna muestra de esputo arrojó un cultivo positivo. Una revisión de la literatura médica permitió concluir que una BK positiva después de completar el tratamiento ocurre hasta en 5 por ciento de los casos pero, no siempre indica un fracaso en la terapia como señalan definiciones internacionales. Para una mejor evaluación de este tipo de pacientes, en circunstancias en que no se dispone del cultivo, discutimos un algoritmo que toma en cuenta la gravedad de la enfermedad al ser diagnosticada, el cumplimiento del tratamiento, la condición clínica del paciente al finalizar el mismo y la tasa de resistencia in vitro de M. tuberculosis en la comunidad, para así definir mejor un fracaso de tratamiento.

International agencies for tuberculosis (TB) control (WHO, IUATLD, KNCV) consider the presence of acid-fast bacilli (AFB) in the sputum smear after completion of TB therapy as treatment failure. We describe a case of a pulmonary TB patient who received and correctly completed 6 months of antituberculous treatment with a positive AFB sputum smear. Treatment was continued and sputum cultures were performed for resistance determination. After 9 months, despite the persistence of AFB in the sputum smear, the treatment was suspended because none of the sputum samples yielded a positive culture, indicating no viable bacilli. In addition, the patient was asymptomatic and had recovered his body weight. An exhaustive review of medical literature allowed us to conclude that a positive sputum smear after therapy has been detected in up to 5 percent of cases and does not always represent a treatment failure as defined by international guidelines. For scenarios where culture methods are not available we propose a scheme to evaluate these patients. This includes compliance with the treatment, severity of the disease at the moment of diagnosis, clinical symptoms after specific therapy and rate of in vitro resistance of M. tuberculosis in the community.

Evaluación de dos pruebas comerciales para el serodiagnóstico de la tuberculosis pulmonar / Evaluation of two commercial tests for the serodiagnosis of pulmonary tuberculosis

Two commercial serological tests, Pathozyme- TB complex plus™ and Pathozyme-Myco IgG™, were evaluated for their sensitivity and specificity in HIV negative patients with serum samples from pulmonary tuberculosis (TB) patients and tuberculin positive, healthy controls. The sensitivity for the two tests was 50 and 80 percent respectively and the specificity 95 and 80 percent>. With a prevalence of pulmonary TB of 10 percent> in symptomatic patients who consult our laboratory, the positive predictive values (PPV) for the two ELISA tests were 92 and 80 percent>, and the negative predictive values (NPV) 98 and 80 percent> respectively. In the same patient group, the AFB smear has a PPV of 100 percent> and a NPV of 97 percent>. We conclude that AFB smear is a better mass screening tool than ELISA in symptomatic patients who consult our laboratory. The test could be useful as a complementary test in excluding or confirming TB in selected, smear negative, symptomatic patients with high degree of clinical suspicion of active TB.

Dos pruebas serológicas, Pathozyme-TB complex plus® y Pathozyme-Myco IgG® fueron evaluadas por su sensibilidad y especificidad con suero de pacientes, no infectados por VIH, con tuberculosis (TBC) pulmonar y personas sanas con la prueba de tubercu-lina positiva. La sensibilidad y la especificidad de ambas pruebas fueron de 50 y 80 por ciento>, 95 y 80 por ciento>, respectivamente. Con una prevalencia de TBC pulmonar de 10 por ciento entre los pacientes que consultan nuestro laboratorio, los valores predictores positivos (VPP) para ambos ensayos fueron de 92 y 80 por ciento>, respectivamente, mientras que los valores predictores negativos (VPN) fueron de 68 y 80 por ciento. En el mismo grupo de estudio, la baciloscopia tuvo un VPP de 100 por ciento y un VPN de 97 por ciento. Se concluyó que la baciloscopia es una mejor herramienta diagnóstica para descartar TBC en pacientes. Sin embargo, debido a los altos VPN y VPP de las pruebas de ensayo de ELISA, éstas pueden resultar útiles como pruebas complementarias para excluir o confirmar la enfermedad en determinados pacientes, con baciloscopia negativa y alta sospecha clínica de TBC.

Estado de portador de Streptococcus pneumoniae y morbilidad por infecciones respiratorias agudas (IRA) en la población infantil Warao / Pneumococcal carriage and morbility caused by acute respiratory tract infections among Warao indigenous children

Anualmente 1.9 millones de niños menores de 5 años mueren por una infección Respiratoria Aguda (IRA) y según la OMS el Streptococcus pnumoniae es responsable de mas de 1 millón en países en desarrollo. Determinar la frecuencia de portadores de S. Pneumoniae, los serotipos de las cepas aisladas, la presencia de dichos serotipos en la vacuna conjugada 7- valente (Prevener, Wyeth) y la morbilidad por IRA en la población infantil Warao menor de 5 años en tres comunidades del Estado Delta Amacuro: san Francisco de Guayo, Nabasanuka y Santa Catalina. Estudio de campo, epidemiológico, transversal y comparativo entre mayo de 2004- enero 2005 que incluyó estudio microbiológico de 110 muestras de hisopado nasofaríngeo y evaluación clínica de 259 niños. 42,7% de los niños estaba colonizado por S. Pneumoniae. Se aislaron 47 cepas, porcentaje de portadores: Nabasanuka 55% Guayo 37,7%, Santa Catalina 29,4%. Serotipos aislados incluidos en la vacuna conjugada 7-valente (19F, 6B y 23F) con 19,15%, 12,8%, 18,6%. Al comparar las proporciones de IRA versus estado de portador de S. Pneumoniae por comunidad no hubo una relación estadísticamente significativa. La población infantil Warao presenta una alta colonización por S.pneumoniae 42,7%. Los serotipos encontrados implican teóricamente una cobertura de 70,23% de la vacuna conjugada 7-valente. Los niños Warao podrían beneficiarse con un programa de vacunación. El mayor porcentaje de IRA y de portadores correspondió a la Comunidad de Nabasanuka.

Estudio de la respuesta inmunitaria en niños Warao de comunidades con alta prevalencia de tuberculosis.

Resumen. En una población de niños Warao menores de 15 años con una tasa de prevalencia de tuberculosis (TBC) de 3190/100.000 se planteó como objetivo, estudiar ciertos parámetros de la respuesta inmunitaria en una población de 107 niños, de éstos, 32 presentaban TBC (27 PPD positivos y 5 PPD negativos) y 75 eran controles sin clínica de TBC (45 PPD positivos y 30 PPD negativos). Se evaluaron la inmunidad humoral, celular y algunos aspectos de la inmunidad innata. Entre los niños pacientes y controles, no se encontraron diferencias significativas en los componentes C3 y C4 del complemento. En cuanto a la inmunidad humoral, el grupo de pacientes presentó un alto porcentaje de niños con niveles totales de IgA e IgG elevados (13,8% y 79,3%, respectivamente) en comparación con los niños controles (0% y 69,2%). En el grupo control, un alto porcentaje de niños presentaron niveles totales de IgM e IgAs elevados (69,2% y 56,16%, respectivamente) en comparación con los pacientes (48,3% y 31,25%). El 100% de los niños presentó altos niveles séricos de IgE. Los estudios de la respuesta celular retardada mostraron que los niños de mayor edad presentaron las mayores medidas de induraciones. Los niños menores de 7 años presentaron similar reactividad positiva al PPD independientemente de la presencia o no de cicatriz de BCG. Un alto porcentaje de niños sin y con cicatriz (46,8% y 27,6% respectivamente) presentaron medidas de induraciones a la tuberculina de 0 mm. La reactividad a Candida mostró un 80% de niños con estados de anergia no específica. Sin embargo, el mayor porcentaje de niños con TBC estaba vacunado y presentaba positividad a la prueba de tuberculina. En conclusión, en los niños Warao se observó un aumento en los niveles de los componentes C3 y C4 del complemento y una hipergammaglobulinemia. Los resultados de los isotipos mostraron que, la disminución de IgAs podría ser un marcador de enfermedad activa, mientras que el aumento de IgM un marcador de infección reciente. La policlonalidad fue independiente de la reactividad al PPD.

Abstract. The present study was carried out in a Warao childhood population with extremely high tuberculosis (TB) rate of 3190/100,000 in 0-15 years old children. One hundred seven serum and saliva samples were tested, 32 from patients with active TB (27 positive and 5 negative for the tuberculin skin test, TST) and 75 apparently healthy contact children (45 positive and 30 negative for the TST). The innate, immunoglobulin and cellular responses were studied. The results showed that both, patients and controls, had a high percentage of children with increased levels of complement C3 and C4 components. A high percentage of children with increased total serum IgA and IgG (13.8% and 79.3% respectively) was observed in children with TB in comparison to control children (0% and 69.2%). A high percentage of control children had increased levels of IgM and sIgA (69.2% and 56.16%, respectively) in comparison to patients (48.3% and 31.25%). Both groups showed children with increased levels of IgE. The results concerning to the cellular immune response to PPD and the BCG vaccination status showed that there was a correlation between an increase in PPD reactivity and age. The PPD reactivity in children less than 7 years old was similar and also independent of the BCG vaccination status. A significant number of children without or with scars (46.8% and 27.6%, respectively) showed induration values of 0 mm to tuberculin skin test. The Candida reactivity showed a high percentage of children (80%) with anergy status. In conclusion, an increase in the levels of complement components C3 and C4 and hypergammaglobulinemia was observed in Warao children, and these results were independent from PPD reactivity and BCG vaccination. The isotype results showed that the decrease in sIgA could be and active disease marker, while the increase in IgM levels could represent a marker of recent disease.